بر اساس گزارش ارسالی به «سحام»، دادگاه رسیدگی به اتهامات محمد مظفری روز ۱۴ اردیبهشت ماه در ساعت ۱۰ صبح در محل شعبه ۱۵ دادگاه انقلاب به ریاست قاضی صلواتی برگزار شد.
در این دادگاه نعمت احمدی و زینب مظفری، وکلای وی حاضر بودند و با دفاغ از موکل خود لایحه دفاعیه را به دادگاه ارائه نمودند.
اتهامات آقای مظفری در این پرونده «تبلیغ علیه نظام»، «اجتماع و تبانی»، «عضویت در سازمان دانشجویان و دانش اموختگان جبهه ملی ایران»، «توهین به رهبری»، «حمایت از زندانیان سیاسی و خانواده آنها»، «حمایت از مادران پارک لاله» و «استفاده و نگهداری تجهیزات ماهوارهای» عنوان گردیده است.
مظفری ۲۶ بهمن ماه سال ۹۳ بازداشت و به بند دو- الف، بازداشتگاه اطلاعات سپاه پاسداران در زندان اوین، منتقل شد. او پس از سه ماه و با پایان بازجوییها به بند هشت منتقل و بیست و یکم تیرماه ۱۳۹۴ پس از پنج ماه بازداشت موقت به قید وثیقه آزاد شد.